Dolina Bugu stanowi istotny element wspólnego transgranicznego ekosystemu. Odgrywa ważną rolę w bezpieczeństwie ekologicznym, gdyż świadczy kluczowe usługi ekosystemowe. Obszar ten nie jest jednak pozbawiony zagrożeń, takich jak zanieczyszczenia, nielegalne składowiska odpadów, niski poziom recyklingu odpadów, niska świadomość wrażliwych kwestii wśród podmiotów działających na rzecz ochrony środowiska i mieszkańców oraz niewystarczająca ilość terenów zielonych w miastach.
Projekt CleanBug ma na celu ochronę bioróżnorodności ekosystemu Doliny Bugu poprzez wspólne działania na rzecz ograniczenia zanieczyszczeń, rozwoju zielonej infrastruktury oraz promowania edukacji ekologicznej. Obejmuje on rozbudowę infrastruktury gospodarki odpadami o specjalistyczne śmieciarki i utworzenie 18 miejsc do segregacji odpadów oraz likwidację nielegalnych składowisk odpadów po obu stronach granicy o łącznej powierzchni 4,561 ha (1 ha w Polsce i 3,561 ha w Ukrainie). Oprócz tego, planowana jest renowacja wysypisk poprzez posadzenie około 500 drzew oraz wzbogacenie terenów zurbanizowanych i zdegradowanych w zieloną infrastrukturę w miejscowości Dobrotwór o powierzchni 2,95 ha. Projekt obejmie również oczyszczenie brzegów i koryta rzeki Bug, a także szeroko zakrojoną kampanię edukacyjną. Ponadto w Drohiczynie powstanie innowacyjna przestrzeń wystawienniczo-edukacyjna. Badanie najlepszych praktyk w zakresie ochrony różnorodności biologicznej Doliny Bugu i postępowania ze stałymi odpadami komunalnymi zostanie podsumowane w podręczniku dobrych praktyk. Działania projektowe obejmą 4 obszary „Natura 2000” i 5 innych obszarów chronionych. Około 3000 osób weźmie udział w działaniach projektowych, takich jak wizyty studyjne, konferencja, akcje sprzątania, konkurs i pikniki.
Dzięki realizacji projektu poprawi się stan ekosystemu Doliny Bugu, co przyczyni się do rozwoju turystycznego regionu.